DL_Poly : uma breve revisão teórica e aplicações práticas de dinâmica molecular clássica

Abstract

RESUMO: Resumo : Dinâmica Molecular Clássica é um dos grandes ramos de pesquisa da área de Física Atômica e Molecular. Assim como outras sub-áreas da Física, ao longo dos anos 80 e 90, ela também passou por diversas transformações na forma de se pesquisar tendo em vista o advento e popularização dos supercomputadores, além do surgimento dos grandes códigos. Um desses grandes códigos que envolvem simulações de Dinâmica Molecular Clássica é o software DL Poly. Tal código, desenvolvido por um grupo de pesquisadores norteamericanos, tem sido amplamente utilizado no desenvolvimento de pesquisas em escala atômica e molecular, que são do interesse de áreas voltadas para o desenvolvimento de novos materiais até investigações teóricas de sistemas biológicos. O presente trabalho de conclusão de curso teve como objetivo principal, apresentar de forma rápida, didática e concisa uma revisão histórica e teórica acerca desse código. Além desse conteúdo revisional apontando potencialidades e aplicabilidades direta do código, o trabalho contemplou a instalação, manutenção, execução de dois testes de calibração no código fonte da plataforma DL Poly Classic versão 4.0, interpretação de alguns resultados obtidos com esses testes, além da exposição de um conjunto de softwares/ferramentas uxiliares que são extremamente úteis na confeccção e manipulação dos arquivos de input e output do código DL Poly Classic versão 4.0.

ABSTRACT: Classical Molecular Dynamics Simulations is one research branches of the big area of Molecular Atomic Physics. Like other sub-areas of physics, along the years 80 and 90, it pass through some transformations in the form of developing scientific researches, since the popularization of supercomputers and beyond the Great Codes domain. One fo these Great Codes involving classical molecular dynamics simulations is the software DL Poly. This code, developed by a north american group, has been widely used in the development of research in atomic and molecular scale, which are of interest for researchers in the areas related to the Development of New Materials, theoretical investigations of Biological Systems, and others. The present work had as main objective to show on didactic and concise way a historical and theoretical review about this code. Besides this revisional content pointing capabilities and direct applicability of the source code, the present work included the installation, maintenance, execution of two calibration tests of the platform DL Poly classic version 4.0, interpretation of some results obtained with these tests, and the exhibition of a set of softwares/tools that are extremely useful in fabrication and manipulation of input and output files.