Estudo da dissimilaridade genética e obtenção de marcas moleculares associadas a características de interesse em variedades do gênero citrus

Abstract

O gênero Citrus possui uma ampla variabilidade fenotípica e genotípica. Estudos de caracterização e uso dos acessos são de grande relevância para o melhoramento de plantas. Neste sentido, objetivou-se caracterizar, via marcadores do tipo microssatélites, dez variedades de Citrus do BAG do Ifes Campus de Alegre e identificar e associar regiões do DNA a caracteres provenientes de caracterização morfoagronômica, físico-química e quimiotípica. Para a caracterização molecular foi utilizado 13 iniciadores microssatélites. A partir das bandas polimórficas, foram detectados e calculados o número de alelos e a construção do dendrograma foi feita pelo método UPGMA no programa Genes utilizando a matriz de dissimilaridade. Posteriormente foi realizada uma associação dos perfis eletroforéticos com as características fenotípicas, pala metodologia de GWAS no programa TASSEL 5.2.1 por meio do Modelo Linear Misto de Máxima Verossimilhança. Dos 13 iniciadores microssatélites utilizados, 12 apresentaram polimorfismo, sendo detectados 36 alelos. Os iniciadores CMS-16 e CCSMEc8 foram os que apresentaram maior polimorfismo. O dendrograma gerado foi composto por quatro grupos, a saber: grupo 1 - ‘Limão Taiti’ e ‘Limão Branco’; grupo 2 - ‘Laranja Bahia’, ‘Laranja Lima’, ‘Laranja Seleta comum’, ‘Laranja Pêra Rio’, ‘Laranja Sanguinea’ e ’Laranja Natal Folha Murcha’; grupo 3 - ‘Tangerina Pokan’ e grupo 4 - ‘Laranja Pêra Mel’. Por meio da análise de GWAS no programa TASSEL não foi verificada associação a 1 e 5% de significância com uso da correção de Bonferroni para as características morfoagronômicas e físico químicas. Já para as características quimiotípicas, o alelo 1 do iniciador CMS-16 mostrou boa associação para as características α-Muurolene, Thymol methyl ether e Espatulenol. A caracterização molecular foi eficiente para estimar a diversidade genética entre as variedades de Citrus, evidenciando significativa divergência. A correlação de marcas moleculares aos diferentes tipos de caracterizações foi baixa, sugerindo-se uma continuidade e ampliação do número de microssatélites utilizados.