Estudo por docagem molecular da atividade da 2’-hidroxiflavanona na quinase NDK do organismo humano e do protozoário Leishmania amazonensis.

Abstract

A leishmaniose é uma doença infecciosa, endêmica de regiões rurais, provocada por protozoários do gênero Leishmania, que são transmitidos através da picada de mosquitos da subfamília Phlebotominae. Esta enfermidade, endêmica de áreas tropicais, é considerada negligenciada e possui tratamentos insatisfatórios por apresentarem muitos efeitos colaterais, alguns podendo ser fatais. A busca por novos e alternativos tratamentos se faz necessário no combate deste mal. A pesquisa e a produção de fármacos de origem natural têm crescido e se apresentado como um caminho promissor. Este trabalho consistiu em analisar, computacionalmente, utilizando a técnica de docagem molecular, a interação entre fármacos de referência e substâncias alternativas, utilizadas a fim de combater a leishmaniose, tendo como alvo molecular a quinase NDK de Leishmania amazonensis, Leishmania major e do organismo humano. Foram obtidos em bancos de dados de moléculas químicas as enzimas NDK das três espécies para a realização dos cálculos. A aplicação da metodologia de modelagem comparativa foi necessária, para completar a sequência da NDK de Leishmania amazonensis, que possuía trechos incompletos em sua estrutura tridimensional. Softwares freeware foram utilizados para a otimização de estruturas moleculares a fim de obter resultados melhores e mais confiáveis. As moléculas de fármacos de referência como, pentamidina, glucantima e paromomicina, foram utilizadas como parâmetros para comparação. Resultados favoráveis foram obtidos com o fármaco pentamidina e com os potenciais fármacos 2’-hidroxiflavanona e quercetina. Os dois últimos, por estarem em fase de pesquisa e apresentarem bons resultados no decorrer do trabalho, mostraram ser moléculas promissoras e bons alvos de estudos complementares ao que já se encontra na literatura; com foco especial na 2’-hidroxiflavanona que já possui testes in silico, in vitro e in vivo com resultados satisfatórios.

Leishmaniasis is an infectious disease, endemic to rural regions, caused by protozoa of the genus Leishmania, which are transmitted through the bite of mosquitoes of the Phlebotominae subfamily. This disease, endemic to tropical areas, is considered neglected and has unsatisfactory treatments because it has many side effects, some of which can be fatal. The search for new and alternative treatments is necessary to combat this disease. The research and production of drugs of natural origin has grown and presented itself as a promising path. This work consisted of analyzing, computationally, using the technique of molecular docking, the interaction between reference drugs and alternative substances, used in order to combat leishmaniasis, having as molecular target the NDK kinase of Leishmania amazonensis, Leishmania major and the human organism. NDK enzymes from the three species were obtained from chemical molecule databases to perform the calculations. The application of the comparative modeling methodology was necessary to complete the NDK sequence of Leishmania amazonensis, which had incomplete stretches in its three-dimensional structure. Freeware software was used for the optimization of molecular structures in order to obtain better and more reliable results. The molecules of reference drugs, such as pentamidine, glucantime and paromomycin, were used as parameters for comparison. Favorable results were obtained with the drug pentamidine and with the potential drugs 2'-hydroxyflavanone and quercetin. The last two, for being in the research phase and presenting good results during the work, showed to be promising molecules and good targets for studies complementary to what is already found in the literature; with a special focus on 2'-hydroxyflavanone, which already has in silico, in vitro and in vivo tests with satisfactory results.